假设是科学认识的重要步骤，也是科学发展的形式。

一般认为，科学理论的发展，都要经过假设的阶段，都以假设的形式向前推进，并发展为科学理论的。另外假设不仅在自然科学里广泛使用，而且在社会科学里也应用颇多，“假设-验证”理论框架逐渐成为自然科学抑或社会科学的一种研究范式。

很多问题的发现解决和理论的形成有赖于假设的提出，假设的形成是提出问题的过程，有时提出问题比解决问题更重要，假设思维的形成有利于提出好的问题。比如物理学中原子构造的假说。化学中关于电离的假说，生物学中关于叶绿素发生过程的假说，以上理论，开始都是以假说的形式提出问题，以假说为起点进行研究，如果验证假说，则形成理论，如果证明假说不成立，则假说为假。

假设的提出是为后续的研究活动形成逻辑起点，也就是后续的实验开展是以假设为基本前提，实验形成结论验证假设，则假设成立，如果与假设矛盾，则假设不成立。这是假设-验证理论框架的基本原理。

统计学中的假设-检验的基本思想即为此，首先做原假设，然后以原假设为前提条件（即原假设为真），以参数为变量进行概率计算，如果P值<0.05，即原假设为真时发生的可能性为小概率事件，即原假设不可能发生，假设不成立。反之亦然。

风险投资中的很多投资方法论也有使用“假设-验证”的思想，比如对商业模式的假设、目标客户的假设等，然后进行小范围内的验证，验证成功，则可以大规模的落地复制。如果验证失败，重新假设验证……

关于药物开发中的“假设-验证”理论多用于新药(505(b)(1))改良型新药(505(b)(2))，方法论步骤首先是假设（即提出问题），然后开展试验对假设进行验证。

药物开发中的假设新药开发通常为一个新靶点/机制/通路/新分子实体对某个适应症具有效果，可以满足未获满足的临床需求，然后以假设作为逻辑起点，设计试验，比如合成，选择先导化合物进行动物试验，临床试验，证实是否具有有效性和安全性。而改良型新药的假设一般为提高有效性/安全性，改善依从性，然后设计试验，即形成证据的过程，验证假设是否成立。

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